上海到成都物流1995年前后，香港民间就有了修建连接珠海和香港的跨海大桥的声音，但当时存在技术和建设管理的诸多困难。2002年，香港特区政府提出建设连接香港和珠江西岸的通道。经过粤港澳三地政府一年多的讨论，共识逐渐形成，并得到了中央政府的支持。2003年8月4日，国务院正式批准三地政府开展港珠澳大桥前期工作，并同意粤、港、澳三地成立“港珠澳大桥前期工作协调小组”（以下简称协调小组），全面开展各项前期工作。

　　 2004年8月，朱永灵放弃了广东省高速公路有限公司董事长的职务，上海到成都物流来到港珠澳大桥前期工作协调小组办公室出任主任。2006年，受协调小组委托，中交公规院开始了大桥工程可行性研究工作为项目决策提供依据。有一个令许多专家惊讶的细节，在通航孔桥梁的形式上，大桥办和设计团队在全世界范围内展开咨询，共提出100多个方案，这些方案都达到了相当高的水平。这是桥梁建设上是从未有过的，桥梁工程也会提出几个方案,但数量很少超过10个。一位桥梁专家说：“这甚至比方案竞赛还要充分。”协调沟通粤港澳三地在许多重大问题上的不同意见，是最困难的工作。一份材料显示，口岸的位置、融资方案和比例、大桥线位、桥隧岛结合方案，是三地曾经出现重大分歧的四个问题。